De Plaza de Armas van Iquitos, die ook wel bekend staat als Plaza Mayor, is het voornaamste plein van de stad. Daardoor is het ook de grootste toeristische bezienswaardigheid van Iquitos. Hetgene dat deze Plaza de Arma onderscheidt van anderen is het oorlogsmonument in het midden van dit plein. Daarnaast is er elke nacht een fonteinshow te zien hier.
De Iglesia Matriz is een katholieke kerk gelegen aan de Plaza de Armas. Het is een zowel een historisch als een cultureel erfgoed van Peru en werd gebouwd aan het begin van de 20e eeuw. De neo-Gotische kerk heeft slecht één naaf, die wordt bedekt met een gewelf. Met haar 20 meter is dit ook het hoogste gebouw van de hele stad.
Het Casa de Fierro gelegen nabij het Plaza de Armas is een huis dat helemaal gemaakt is van ijzer en wel twee verdiepingen heeft. Het huis is ontworpen door Gustave Eiffel en heeft dus veel Europese invloeden met haar balkonnetjes en arcades. Het huis diende eerst voor sociale evenementen en culturele exhibities. Nu wordt het huis echter gebruikt als apotheek met conferentiekamers. Het Ijzeren Huis is benoemd tot Cultureel Erfgoed van Peru.
Het Museo de Culturas Indigenas Amazonicas is een museum dat bezoekers de mogelijkheid geeft om de wereld van de bewoners van het Amazone regenwoud te betreden. Het museum stelt namelijk oude artefacten, instrumenten, ornamenten, wapens en kronen tentoon van de oude bewoners van dit gebied. Het museum is elke dag geopend van 8:00 tot 19:30.
Het Ayapua, of het Museo Barco Histórico Ayapua hoe het volledig heet, ligt aan de oever van de Itaya rivier en werd gebouwd in Hamburg. Het museum heeft namelijk tien exhibitie hallen die verschillende voorwerpen van de marine tonen, zoals telescopen en kompassen. De scheepvaart ging vroeger vaak gepaard met wetenschap. Dit is dan ook te reden dat er een eeuwenoude biblotheek te vinden is gevuld met boeken, kaarten en andere documenten. Het museum is elke dag open van 9:00 tot 17:00.
Het Plaza 28 de Julio ligt in het zuidwesten van het historische centrum van Iquitos. Dit plein is naast het Plaza de Armas het belangrijkste plein van de stad. Het plein werd geopend voor het publiek op 28 juli 2011 ter eren van de onafhankelijkheid van Peru op 28 Juli 1912.
The Barrio de Belén is also known as La Venecia Amazónica or Belén. Belén is one of the tourist spots in Iquitos and is divided into Alto Belén and Bajo Belén. The architecture of Belén almost entirely consists of stilts and house rafts. Because of the rise and fall of the Itaya River, suburban life changes pace every season.
The Pilpintuwasi Butterfly Garden is located in Padrecocha, 20 minutes north of Iquitos, on the banks of the Nanay River. "Pilpintuwasi" means “house of butterflies” in Quechua. Being the only butterfly farm in Peru, the garden is an important tourist attraction of Iquitos. In total, the Mariposario Pilpintuwasi contains 42 species of butterflies living in the Amazon, amongst them them, Blue Morpho (Morpho menelaus).
Het Lago Zungarococha is een meer gelegen op ongeveer 30 minuten van Iquitos. Het is de perfecte plek om te flaneren of om jezelf te vermaken met dingen als kanoën, sportvissen of zwemmen.
Het Pacaya Samiria Nationaal Reservaat ligt op 180 kilometer van de stad Iquitos. Het reservaat is vernoemd naar de twee rivieren die hier stromen, de Pacaya en de Samiria. Als het grootste nationaal reservaat van Peru biedt Pacaya Samiria een grote diversiteit in wildlife en zeeleven aan. Zo zijn er bijvoorbeeld bijna 500 vogelsoorten te zien, meer dan 100 zoogdieren en bijna 300 vissoorten. Hieronder zijn er ook een paar gevaarlijke dieren, zoals de jaguar, de zwarte alligator en de zeekoe.